L’établissement public est administré par le comité syndical (équivalent d’un conseil d’administration) du syndicat mixte de gestion du Parc naturel régional du Verdon, qui prend les grandes décisions (budget, créations des emplois, statuts, orientations).
Il est composé de représentants des collectivités adhérentes au syndicat.
Le comité syndical peut se réunir en plénière, pour traiter des sujets généraux.
Selon les points à l’ordre du jour le comité syndical peut également se réunir par objet «Gestion globale de l’Eau» ou «GEMAPI».
Le comité syndical « GEMAPI » pilote la mise en œuvre de cette compétence.
Il regroupe les 7 intercommunalités du bassin versant du Verdon ayant confié leur compétence GEMAPI à l’EPAGE :
- Communauté de communes Alpes Provence Verdon,
- Durance Luberon Verdon Agglomération,
- Communauté de communes Lacs et Gorges du Verdon,
- Communauté de communes Provence Verdon,
- Dracénie Provence Verdon Agglomération,
- Communauté d’agglomération du pays de Grasse,
- Provence Alpes Agglomération.
Pour les affaires courantes, l’établissement public est dirigé par le bureau du syndicat mixte, qui comprend 22 membres élus au sein du comité syndical, et animé par le Président.